m6A研究又有新手段了？赶紧来了解一下吧！栏目：研究动态发布时间：2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究热点之一,Cell上新发表了一篇介绍不使用m6A抗体的检测mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究热点之一，目前主要的研究思路包括差异表达的write，reader和eraser基因分析；m6A抗体检测全转录组甲基化水平；分析m6A甲基化水平变化的靶基因和下游机制研究。而在7月25日的Cell上新发表了一篇介绍不使用m6A抗体的检测mRNAm6A水平的Resource文章，小编时间和大家分享一下。作者开发这一方法的前提是有研究报道了MazF能特异性的识别无修饰的ACA序列并发挥RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的个A发生m6A甲基化之后将无法被MazF所识别，如图一所示。图1MazFRNA酶作用示意图根据这一原理，作者将纯化后的mRNA进行MazF酶处理，然后再对打断的RNA进行逆转建库测序。对于无修饰的位点，ACA处被完全剪切，测序reads正好分布于该位点上下游而且比对至该处的上下游reads数是相同的.如图2所示。而甲基化位点的reads会包含上下游的序列。作者开发了MAZTER-MINE软件包专门进行分析（图3）。动物疾病模型还为科研人员提供了研究人类疾病的跨学科方法。上海组织科研技术服务分离

RNA甲基化修饰（m6A）研究RNA甲基化修饰约占所有RNA修饰的60%以上，而N6-甲基腺嘌呤（N6-methyladenosine,m6A）是高等生物mRNA和lncRNAs上为普遍的修饰。目前发现microRNA，circRNA,rRNA,tRNA和snoRNA上都有发生m6A修饰。m6A修饰主要发生在RRACH序列中的腺嘌呤上，其功能由“编码器(Writer)”、“消码器(Eraser)”和“读码器(Reader)”决定[1]。“编码器(Writer)”即甲基转移酶，目前已知这个复合物的成分有METTL3，METTL14,WTAP和KIAA1429；而ALKBH5和FTO作为去甲基酶（消码器）可逆转甲基化；m6A由m6A结合蛋白识别，目前发现m6A结合蛋白（读码器）有YTH结构域蛋白（包括YTHDF1,YTHDF2,YTHDF3，YTHDC1和YTHDC2）和核不均一蛋白HNRNP家族（HNRNPA2B1和HNRNPC）。m6A酶系统METTL3是早先被鉴定为结合SAM的组件，其缺失引起小鼠胚胎干细胞、Hela细胞和HepG2细胞中m6Apeaks的减少。METTL3及其同源蛋白METTL14定位在富含剪切因子的细胞核内亚细胞器－核小斑（Nuclearspeckle）上，显示ｍ６Ａ修饰可能和ＲＮＡ的剪切加工相关。WTAP与METTL3–METTL14二聚体相互作用，并共定位于核小斑，影响甲基化效率，参与mRNA剪。而KIAA1429作为候选的甲基转移酶复合体的新亚基。上海疾病科研技术服务服务将Transwell小室放入配套培养板中，形成由细胞可穿透性膜分隔开的两室系统，将高营养液与低营养液分隔开。

二甲苯Ⅰ、Ⅱ各15min至透明。（2）放入二甲苯和石蜡等量混合液处理15min，再放入石蜡Ⅰ、Ⅱ透蜡各50~60min。透蜡在恒温箱内进行，箱内温度保持在55~60℃左右。4、包埋（1）用镊子夹取蜡模在酒精灯上稍加热，并倒入少许从温箱中取出的纯石蜡。（2）再将镊子在酒精灯上稍加热，夹取材料将切面朝下放入蜡模中，排列整齐，再放上包埋盒，轻轻倒入熔蜡。5、切片、展片、贴片（1）将包埋好的石蜡块固定在切片机上，调整厚度调节器到所需的切片厚度，一般为4~6μm。（2）切下的组织薄片要放到加热的水中烫平，再贴到载玻片上，放45℃恒温箱中烘干。二、HE染色1、脱蜡、复水（1）保持水浴锅温度为60℃，将切片放入干燥的染色缸内，放入水浴锅中，30min至蜡熔化。（2）石蜡切片经二甲苯Ⅰ、Ⅱ脱蜡各5min，然后放入100%、95%、90%、80%、70%各级酒精溶液中各3~5min，再放入蒸馏水中3min，以便染料可以进入组织。2、染色、脱水（1）切片放入苏木精中染色约10~30min，用流水冲洗约15min，使切片颜色变蓝。（2）将切片放入1%盐酸乙醇液中褪色，几秒后见切片变红、颜色较浅即可，后将切片再放入流水中使其恢复蓝色。（3）切片放入50%、70%、80%乙醇中各3~5min。

准备碎冰和。把膜置于甲醇溶液中活化1分钟，然后转移至转膜液中平衡3分钟后备用。2、转膜组装转膜三明治夹，这一步很关键，重要的是胶和膜之间不能有气泡且膜与胶要保证贴合紧密(否则会翻车)，可以加多点转膜液泡着。组装好后加满转膜液，设置电源参数，我习惯恒流转膜，200-280毫安，1-2小时，根据分子量定，如50KD的分子用60分钟就够了。如果一个电源带两个转膜大槽即四块胶，我就会用恒压70-110V。这个过程重要的是做好降温。这里简单说一下蛋白分子量与玻璃板厚度，分离胶的浓度，转膜电源参数的选择问题。如果是能用1毫米的玻璃板就不用，因为转膜是在电场的作用下蛋白分子从胶上迁移到膜上，1毫米胶的蛋白迁移距离要比。选择更薄的胶蛋白转膜时间可以减少，从而减少发热，以免胶变形，条带也会更好看。然后是分离胶的浓度，如果是150—200KD的分子选10%以下的的分离胶，200—300KD的选8%的,300KD以上的选6%的，小于30KD的200mA30分钟，30-100KD的按分子量的数值算，如70KD，250mA70分钟;100-150KD的250mA100分钟;150—300KD的分子转膜条件用280毫安(以上均是对于，)，120分钟足矣，前提是胶的浓度相适应。五、封闭孵一抗1、封闭转膜结束后。常见的5种实验动物取血方式，你掌握几种？

痉挛型脑性瘫痪(SCP)大鼠模型【简介】痉挛性脑瘫指发育异常引起的运动和感觉功能落后，造成肢体肌张力增高、腱反射亢进等一系列综合征。本实验利用脑立体定位解剖图谱,对大鼠的锥体束部位进行精确的立体定位,通过微量注射器对大脑锥体束所在部位注射无水乙醇造成锥体束坏死,的模拟了痉挛型脑瘫的解剖学及病理改变,术后大鼠产生明显的屈曲痉挛症状,且屈肌肌张力增高,症状和体持续时间较长,稳定性良好。从而建立一种可复制性良好且痉挛持续时间较长的稳定的大鼠痉挛型脑瘫动物模型,为进一步深入的探究痉挛型脑瘫的基础研究和临床诊治打下基础【目的】痉挛型脑性瘫痪(SCP)大鼠模型建立【动物】SPF级SD大鼠，雄性，周龄6~8W，体重：200~250g【方法】1、大鼠麻醉，颅顶脱毛备皮；2、大鼠脑定位仪固定大鼠，颅顶正中切口，长度约2cm开口暴露前囟及矢状缝；3、缝线将皮肤左右分开固定，前囟后10mm、矢状缝左侧；4、微量注射器移至开孔处修正骨孔，注射器垂直向颅内插入，缓慢注射无水乙醇15ul，注射完移除注射器，棉球压迫止血；5、缝合创口后维持25°体温，等待苏醒，观察大鼠状态。【观察】术后3天模型大鼠摄食减少、右侧肢体跛行、右前肢不负重、右前肢及右前爪屈曲痉挛明显。在疫苗测试中，动物模型则可以用来评估疫苗的有效性和安全性。上海组织科研技术服务分离

细胞核是细胞的控制中心，它包含了遗传物质DNA，控制着细胞的生长和分裂。上海组织科研技术服务分离

代谢组学的研究对象大都是相对分子量在1000以内的小分子物质，因此常用的血液样本在取样后，应小心操作，防止溶血，尽快分离出血清，分置于温环境下保存。由于用于理实验的动物采集相对其他样品的采集，操作更繁琐，在处理过程中许多细节容易忽略，造成数据不完美（甚至不能用）。因此接下来将重点介绍样品采集的注意事项及其固定。样品采集注意事项应新鲜，操作时间尽可能短，否则细胞发生死后变化、自融及现象。是动物心脏还在跳动时采集，样本取出后在5分钟以内置于固定液内，避免长时间暴露在空气环境中。块尽量小而薄。块的厚度以不超过5mm为宜，较为理想的厚度为2mm左右，主要目的是使固定液迅速而均匀的渗入块内部。勿使块受挤压。在采集过程中，应尽量选择较为锋利的手术，如手术刀片等，避免操作过程中挤压挫伤标本。挤压过的均不可用。固定液的量一般以块大小的20倍为宜，能够在容器内自由移动。尽量保持的原有形态。新鲜经固定后，或多或少产生收缩现象（如胃肠），为此可将展平，以尽可能维持原形。保持清洁。块上如有血液、污物、粘液、食物、粪便等，可用生理盐水冲洗，然后再入固定液，但要注意防止损伤。要熟悉采集部位。要能准确的按解剖部位采集。上海组织科研技术服务分离

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